Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RNF7Q9UBF6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF7Q9UBF6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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