Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL42Q9P2K6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL42Q9P2K6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms