Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHPF2Q9P2E5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms