Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HCN3Q9P1Z3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms