Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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