Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms