Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TREM2Q9NZC2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TREM2Q9NZC2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms