Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms