Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNK4Q9NYG8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms