Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMT1Q9NXH9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRMT1Q9NXH9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms