Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BSDC1Q9NW68 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSDC1Q9NW68 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms