Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FANCLQ9NW38 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms