Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms