Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS45Q9NRW7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms