Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms