Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOBEC3GQ9HC16 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms