Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCAPERQ9BY12 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms