Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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