Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGME1Q9BQP7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms