Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGIP1Q9BQI5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms