Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBA1CQ9BQE3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms