Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms