Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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