Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms