Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCNX1Q96RV3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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