Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALS2Q96Q42 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2Q96Q42 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms