Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM20AQ96MK3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM20AQ96MK3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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