Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP47Q96K76 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP47Q96K76 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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