Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms