Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HHIPL1Q96JK4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HHIPL1Q96JK4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms