Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTV1Q96GA3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms