Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHFRQ96EP1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms