Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIRT1Q96EB6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms