Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD8

SKA1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA1Q96BD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKA1Q96BD8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms