Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAMP4Q969E2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms