Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHMTQ93088 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms