Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD50Q92878 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms