Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4DQ92854 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms