Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRUQ92729 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
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