Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSRNP3Q8WYN3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSRNP3Q8WYN3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms