Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF4Q8WXU2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms