Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms