Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC4Q8TBB5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms