Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HJURPQ8NCD3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms