Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3X1

FNBP4, Formin-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP4Q8N3X1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNBP4Q8N3X1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNBP4Q8N3X1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms