Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLD3Q8IV08 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms