Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMG6Q86US8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMG6Q86US8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMG6Q86US8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMG6Q86US8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG6Q86US8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms