Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms