Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms