Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms